Selain karena keluarganya, keberhasilan Suprapto dalam mengenyam pendidikannya adalah karena kecerdasannya. Ia begitu disiplin dalam hal belajar. Tidak heran jika ia berhasil menyelesaikan pendidikannya dengan hasil yang baik.

Setelah selesai menamatkan pendidikan dasarnya, Suprapto pun melanjutkan pendidikannya ke tingkat menengah yang pada masa itu bernama MULO (Meer Uitgebreid Lager Onderwijs), yaitu sekolah menengah pertama atau setingkat SMP pada masa sekarang.

Kedisiplinan dan keteladanan yang ditanamkan oleh keluarganya merupakan bekal yang kuat bagi Suprapto. Karena itulah ia pun kembali berhasil menamatkan sekolah menengah pertamanya dengan gemilang.